应用需求分析
【电脑商网专稿】上海交大生命科学技术学院使用的生物学软件,主要有BLAST(在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具)、EMBOSS(欧洲分子生物学开放软件包)、Gromacs(分子动力学模拟软件)和DOCK(分子对接软件,利用虚拟的方法对化学分子库进行筛选)等,目前主要运行在PC机和普通工作站上,计算速度慢、运行效能低,已经不能满足科研工作的需要。因此,该学院计划采购一套包括高性能服务器和软件系统的解决方案。通过公开招标的方式,该学院最终选择了联想深腾1800机群服务器。
方案设计
根据该学院的需求情况,联想提出了包括硬件、软件和技术服务在内的整体系统解决方案。在本方案所定制的深腾1800机群中,联想万全服务器采用了Intel Xeon 5300系列CPU,双路计算结点全部配置四核处理器,为用户提供高密度的科学计算能力。
方案特点
高性能:高性能的计算结点是提升机群计算能力的重要因素,联想万全R510 G6支持两颗Intel Xeon Clovertown处理器,每颗CPU集成2×4MB二级缓存;支持Fully Buffer DIMM 533/667内存,容量更大,主频更高。
高可靠性:管理结点R520 G6、存储结点R350 G6全部配置RAID冗余磁盘,保证用户数据安全可靠;联想的机柜系统、机架式服务器结点均经过散热优化设计,既能保证系统的稳定运行,又可有效节约系统耗电量。
标准、开放的机群架构:本设计方案遵循业界通用的并行计算机群设计标准,可以与其它任何厂商的标准部件互联互通。
易管理:机群系统软件是机群服务器的关键部件,采用联想自主研发的机群管理系统LCMS,可以像管理一台服务器一样管理机群的资源;机群资源管理系统LJRS可以对计算结点动态划分逻辑池,结点池划分通过软件设置实现,方便管理使用机群的计算资源。
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