由于这台机器主要应用在限制颇多的数据中心环境，所以IBM System x3650 提供了无与伦比的性能和可靠性。采用了2U机架式结构，标配1颗性能强劲的Xeon 5310四核处理器，核心频率1.60GHz，前端总线1066MHz，四核共享4M二级缓存，最大支持2颗CPU，并支持四核处理器。配备了2*1GB PC2-5300 DDR2 SDRAM (Chipkill)内存，最大支持内存容量48GB，12个内存插槽（10个可用）。

在储存方面，标配中提供146GB硬盘，最大支持1.8TB热插拔SAS硬盘。主板集成了RAID 0、1、10，可以在阵列卡的支持下组成RAID 5、6模式，提供了6个磁盘位，集成了双千兆以太网卡，4个扩展插槽。电源标配为1个，功率835W，冷却系统提供了5个冷却风扇。

基本配置：

IBM System x3650还可以使用 IBM Wake on LANreg; 和 Preboot eXecution （PXE） 的远程部署 通过提供远程管理服务器的能力，Wake on LAN 可以节省您的时间和资金，PXE 可提供对服务器初始化过程的远程控制，节省 IT 工作人员的外出次数和费用；可与 IBM 远程部署管理器一起使用，集成的系统管理处理器 提供全天候远程管理功能。通过持续监视系统和通知潜在的系统故障或变化来提高服务器的可用性

它还支持 IBM Remote Supervisor Adapter II SlimLine 卡选件 与集成的系统管理处理器配合，可提供更强大的系统控制能力，允许远程执行系统管理功能（无论服务器是否正在运行）来减少停机时间。